昨天晚上,北京市疾控中心专家杨鹏在接受央视新闻采访的时候表现:对北京新发地病毒进行全基因组测序发现,病毒是从欧洲方向来的,开端判定与输入性有关。[1]
(央视新闻微博截图)今天,中国疾控中心流行病学首席专家吴尊友接受人民日报专访时表现,从病毒的组成结构来看,此次病毒不像北京两个月以前出现病例的毒株,更像欧洲的,但是欧洲的不代表来自欧洲国家,欧洲的概念是广泛的,包罗要跟美国病毒毒株进行分析,大部门来自欧洲,俄罗斯的病例大部门也是源于欧洲,也就说我们实验室的检测结果显示毒株源于欧洲可能来自欧洲国家,也可能来自美洲国家,也可能来自俄罗斯,还有待与进一步的收集信息来资助判断。[2]
(人民日报微博截图)那么可能很多同学会问,怎么从基因组测序的结果看出来病毒的来源的呢?为什么说是欧洲方向的病毒,又不能确定是来自欧洲还是美国还是俄罗斯呢?
这里边就涉及到生物信息学的基因组比力工作。
我们知道,病毒在复制过程中,是非常容易变异的,病毒在流传到差别地区流传的时候,会产生一些特异性的变异。
打个比方,最早是5个亲兄弟,相互长得都非常像,但是现在5个兄弟分家了,每个人去了一个大洲,然后各自在本地传宗接代,那么他们的后代就携带着5个祖先的特征,但是在后代自我繁殖的过程中会产生各自新的特征。这样几代甚至十几代以后,就会出现本地的家族特色。
举个例子,病毒A0原来的结构是aaabbbcccddd,它在流传中产生了突变,突变的后代变A1成了aaabbacccddd,那么A1它的后代A2可能就会酿成了aaabbaccaddd,A2的后代A3病毒可能会突变为aaabbaccadda。固然这是最简单的一个突变遗传,现实的病毒在突变中会发生非常多的情况,好比逆向突变,重组等等。
但他们的突变还是会有类似的规律的,根据这个突变规律,我们能发现差别地区的病毒特色以及他们的亲缘关系。
我们国家建立了一个新冠病毒的数据库,其中由国家基因组科学数据中心牵头,整合了世界卫生组织(WHO)、中国疾病预防控制中心(CDC)、美国国家生物技术信息中心(NCBI)、全球流感序列数据库(GISAID)等机构公开发布的冠状病毒基因组序列数据。
那么我们根据差别病毒的中间的亲缘远近,可以绘制出一幅系统演化树来。
参考^央视新闻:疾控专家:新发地发现的病毒,基因测序发现来自欧洲方向 https://weibo.com/2656274875/J6D7twY0R?from=page_1002062656274875_profile&wvr=6&mod=weibotime&type=comment^人民日报:吴尊友回应病毒基因测序来自欧洲 https://weibo.com/2803301701/J6KEFEt6r?refer_flag=1001030103_
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